細胞培育基受各種霉菌、細菌和支原體污染后，一般都較難掃除或殺滅，其間以支原體更難掃除，因此從防備著眼為上。
一、抗生素除菌法：用BM－1（截耳素衍生物）和BM－2（四環素衍生物）抑制支原體。
1．抗生素制備：均可用PBS配成250×濃縮液－20℃備用。
2．處理：取受支原體污染的細胞，吸除培育液，參加含BM-1的1640培育液培育3天后，吸除培育液，再參加含BM-2的1640培育液培育4天，如此連續三個輪回。
3．檢測：用33258熒光染色鏡檢（每個輪回末應檢測一次）。
4．培育：鏟除支原體后的細胞，在不加上述抗生素的培育基液中，再傳代培育3～4次。
5．鏡檢：如鏟除不*可再進行處理至純潔停止（一般3個輪回即能被*消除），即先用含BIP培育液培育12天后，再按上述方法處理。
二、加溫除菌法
把受污染的細胞置41℃中作用5～10小時。
三、動物體內接種除菌法
把受支原體污染的腫瘤細胞接種在同種動物皮下或腹腔中，借動物免疫系統消除支原體，而腫瘤細胞卻能在體內持續成長，待一定時間后，從體內取出細胞培育基再進行培育繁衍。
四、巨噬細胞吞噬法
從動物腹腔采取巨噬細胞，為掃除其它細胞成分，可先進行純化，然后再參加被支原體污染的細胞培育液中混合培育。在培育過程中，為查看支原體是否已被消除潔凈，可利用支持物培育法驗證，取出支持物逐日染色、鏡檢調查，至支原體已被消除潔凈停止。
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